科学技术发展研究院（以下简称科发院）是学校深化综合改革，积极加强有组织科研，构建大科研格局背景下成立的学校行政职能部门。承担学校科学技术类科技政策制定、科技规划布局、科研机构管理、科技平台建设、科技项目组织、科技成果管理、技术成果转移转化组织管理等重要职能。统筹负责科学技术类校管科研机构管理和宜宾研究院、涪陵研究院等异地科研机构的业务指导。同时成立科发院党委，加强党建引领，履行科发院及异地科研机构党的建设、思想政治教育、党员干部队伍建设、群团组织、统一战线、意识形态等工作职能。
科发院下设综合管理办公室、科技发展办公室、项目管理办公室、高新技术办公室、平台管理办公室、成果管理办公室、科技伦理与诚信建设办公室、技术转移办公室、产业服务办公室和科研基地管理办公室。科学中心(产业技术研究院、大学科技园管理中心)、科协办公室挂靠科发院。
科发院宗旨：秉承“教育-科技-人才”一体化发展理念，坚持“四个面向”，深入贯彻落实国家创新驱动发展战略，积极服务地方经济社会发展，聚焦学校建设高水平研究型大学核心任务，秉持“精心谋划、细心管理、用心服务”的工作理念，紧密围绕“培育大团队、构筑大平台、争取大项目、产出大成果、促进大转化”开展工作，通过有组织科研推动学校科技事业高质量发展。
