与国内企事业单位联合科研机构

川菜渝味产业发展研究院（共建单位：西华大学，设立时间：2020年）

长江上游马铃薯联合实验室（共建单位：中国农业科学院蔬菜花卉研究所,设立时间：2021年）

农业农村部长江上游水生生物多样性保护研究中心（共建单位：农业农村部长江流域渔政监督管理办公室，设立时间：2021年）

中国农业科学院柑桔研究中心（共建单位：重庆市人民政府、中国农业科学院，设立时间：2024年）

与国（境）外单位联合科研机构

（待补充）